關於 crispr therapy ，我們在網路上蒐集到這些相關的討論、資訊與評價

Bluebird Bio公司用反轉錄病毒做基因療法測試，抽取病人的血液幹細胞，隨機插入正常的血紅蛋白基因，再把細胞移植回病人體內。其中兩位病人五年後得了血癌，公司中止相關測試。儘管這案例不一定是因為基因療法而致癌，但反轉錄病毒致癌的可能仍然存在。Bluebird Bio已確認了一位病人的癌細胞基因組內，有插入療法基因，只是不知道插在哪裡。（你把細胞放回病人前應該確認所有細胞克隆的基因插入點吧？）

我個人覺得在2020年代還用Lentivirus（慢病毒屬）做幹細胞療法是痴線的，因為Lentivirus會把基因直接插到細胞的基因組，有可能病變成癌細胞。另一種病毒，Adeno-associated virus (AAV，腺相關病毒)，由於都有一定程度插入到基因組能力，所以我個人都不信用AAV的幹細胞療法。我個人偏向做CRISPR定點插入，並確保只插入在目標位置，儘管更為繁複，但安全很多。

當然啦，我個人意見而已。

https://www.sciencemag.org/news/2021/02/gene-therapy-trials-sickle-cell-disease-halted-after-two-patients-develop-cancer

轉貼林品均博士的文章：
重點在於投藥治療似乎很有希望!人類真是厲害。

"看了一下 武漢病毒 2019-nCoV (novel Coronavirus) 的幾篇研究研究與新聞，我這邊筆記一下
沒特別編輯，也不夠科普🤣🤣，如果有人看了發現有錯或更新 再提醒我一下🙏

‼️Therapy
目前還沒有任何核發的新病毒藥物，不過好像有幾個好消息 (?) 昨天發表在醫學權威期刊 NEJM 的病例報告 [1]，也就是兩週前在美國華盛頓州第一例確診武漢病毒的中國人，他一開始只有發燒症狀，但住院第5天 (發病第9天) 突然出現肺部異音、肺炎跡象並且惡化很快！ 再加上呼吸急促、血氧驟降 (因肺出狀況) 需供氧治療，這並非典型肺炎處理方法可解決的，醫院只好給予治療 Ebola Virus Disease 的、開發中的 💊remdesivir 試看看...XD

Remdesivir 是個 nucleotide analogue，機制是讓複製酵素 (RdRp) 複製病毒 RNA 時做不下去，原先是開發給 Ebola Virus Disease用的，但 2018在非洲剛果的 673人臨床試驗發現大失敗 [2]，死亡率高於較早開發的另外也在開發的兩隻 monoclonal antibody drugs: MAb114 & REGN-EB3 (bind 病毒上的 glycoprotein 以防止其跟宿主 receptor反應而減少感染 [2]) 。阿因為冠狀病毒也有 RdRp 所以他們就試試看，在2019年底發表了：施用 remdesivir 於 感染 SARS-CoV、MERS-CoV 的小鼠，體內病毒大幅減少 [3]！！！開啟了將這隻藥拿來治療華盛頓州那位病人的試驗。 ps. 沒有拿到新藥試驗許可 或 NDA 就可以開始做臨床跟施藥，也就是所謂「同情用藥」(compassionate use)。）

結果用藥的隔天，他發燒跟肺炎的狀況就好許多[1]！！！開發 remdesivir 的製藥公司 Gilead 應該爽死了。不過...後續的臨床試驗才是考驗.. Gilead 已開始跟中國確診病患們合作，希望都跟第一例試驗一樣順利 (?)

至於中國方面則是使用藥物蛋白質 binding預測，大規模搜尋，找出一些最有機會成為抗 2019-nCoV 的已在市面上的藥 [4]，其中前幾名，💊lopinavir & ritonavir (為 艾伯維 AbbVie 的抗愛滋病毒藥，商品名 Kaletra) (作用是 bind 並抑制 HIV的 protease，使病毒的 polyprotein 無法被切割成為 有功能的 proteins而被抑制) 。且 lopinavir & ritonavir 在當年 SARS爆發時曾被拿出來研究是否可以 in vitro 抑制之，結果可以 [5]。接著中國41位SARS病患施給此藥物後，體內病毒量降低、免疫系統也較控制組活化 [5]！而武漢病毒也是有蛋白需要被 protease 切開，因此也在 off label use情況下，約五天前在武漢直接用在病人身上，目前還沒有發表結果，不過感覺很有希望哦。

‼️Virus origin
可能因為上面愛滋病毒藥的事件，導致一堆人又說起中國改造病毒當生化武器。昨晚一篇線上發表 [6] 更把風向帶到這個陰謀論，害我還花時間去研究.... 這篇尚未 peer reviewd 的線上論文，是印度人做的。 2019-nCoV 既稱為新型冠狀病毒，他跟其他 family members 差異最大的地方就是 genome 中間的 spike protein區 [7]，印度團隊宣稱他們把這段拿去資料庫 BLAST，得到愛滋病毒 HIV 的序列 hit (且是結合免疫細胞的重要蛋白)，宣稱找到武漢病毒 4個 insertions，是其他冠狀病毒沒有 而HIV有的。這篇研究直接導出結論是，不太可能是自然發生而是人為??!.....陰謀論加上扯到愛滋，大家都嚇壞了

不過我實際去將整段，或是他宣稱的短的 motif 去做 BLAST.. 根本找不到 HIV 序列.. 還有在很多細菌或其他生物都能找到一樣的序列...且根本太短 四片段都是 6-8個氨基酸而已。 所以那篇方法應有問題、結論根本粗糙，愛滋病毒跟武漢病毒的連結就只有都會使用到 viral protease而已。然後他們究竟怎麼 BLAST到 HIV的呀？

‼️Diagnosis
目前要診斷 2019-nCoV 的方法只有使用 RT-PCR檢測，必須採樣後送至實驗室，耗時 5-6小時，如果加上排隊或運送（或有時湊不滿一次上機一盒試劑的量而要等待），就可能 24小時以上才知有無感染。所以大家都在開發更即時的方法。昨天 UCSF 與 Mammoth Biosciences (就是 CRISPR應用發明者之一 Jennifer Doudna開的，用 CRISPR核酸配對來偵測病毒 的公司) 宣稱他們已開發用 CRISPR技術 在兩小時內檢測出武漢病毒 [8]！並且是 point-of-care 也就是用試紙或其他方式，在採樣地點（診間、機場、救護車等）就可以測完＋看結果。當然其他大小公司也拼命發新聞稿，不論是開發疫苗、療法或是檢測方法，非常多的研究，希望可以遏止住疫情以及強化科研發展....

-\-\
ref
[1] First Case of 2019 Novel Coronavirus in the United States. NEJM. Jan 31, 2020.

[2] A Randomized, Controlled Trial of Ebola Virus Disease Therapeutics. NEJM. Dec 12, 2019.

[3] Coronavirus Susceptibility to the Antiviral Remdesivir (GS-5734) Is Mediated by the Viral Polymerase and the Proofreading Exoribonuclease. mBio. Mar 6. 2018

[4] https://innophore.com/2019-ncov/

[5] Role of lopinavir/ritonavir in the treatment of SARS: initial virological and clinical findings. Thorax. 2004; 59: 252-256

[6] https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.26.920249v1

[7] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. THE LANCET. Jan 30, 2020

[8] https://www.sfchronicle.com/…/Coronavirus-UCSF-expert-worki…

(最新幾篇研究可能未經同儕審查，應持保留態度)"

轉貼林品均博士的文章：
重點在於投藥治療似乎很有希望!人類真是厲害。

"看了一下 武漢病毒 2019-nCoV (novel Coronavirus) 的幾篇研究研究與新聞，我這邊筆記一下
沒特別編輯，也不夠科普🤣🤣，如果有人看了發現有錯或更新 再提醒我一下🙏

‼️Therapy
目前還沒有任何核發的新病毒藥物，不過好像有幾個好消息 (?) 昨天發表在醫學權威期刊 NEJM 的病例報告 [1]，也就是兩週前在美國華盛頓州第一例確診武漢病毒的中國人，他一開始只有發燒症狀，但住院第5天 (發病第9天) 突然出現肺部異音、肺炎跡象並且惡化很快！ 再加上呼吸急促、血氧驟降 (因肺出狀況) 需供氧治療，這並非典型肺炎處理方法可解決的，醫院只好給予治療 Ebola Virus Disease 的、開發中的 💊remdesivir 試看看...XD

Remdesivir 是個 nucleotide analogue，機制是讓複製酵素 (RdRp) 複製病毒 RNA 時做不下去，原先是開發給 Ebola Virus Disease用的，但 2018在非洲剛果的 673人臨床試驗發現大失敗 [2]，死亡率高於較早開發的另外也在開發的兩隻 monoclonal antibody drugs: MAb114 & REGN-EB3 (bind 病毒上的 glycoprotein 以防止其跟宿主 receptor反應而減少感染 [2]) 。阿因為冠狀病毒也有 RdRp 所以他們就試試看，在2019年底發表了：施用 remdesivir 於 感染 SARS-CoV、MERS-CoV 的小鼠，體內病毒大幅減少 [3]！！！開啟了將這隻藥拿來治療華盛頓州那位病人的試驗。 ps. 沒有拿到新藥試驗許可 或 NDA 就可以開始做臨床跟施藥，也就是所謂「同情用藥」(compassionate use)。）

結果用藥的隔天，他發燒跟肺炎的狀況就好許多[1]！！！開發 remdesivir 的製藥公司 Gilead 應該爽死了。不過...後續的臨床試驗才是考驗.. Gilead 已開始跟中國確診病患們合作，希望都跟第一例試驗一樣順利 (?)

至於中國方面則是使用藥物蛋白質 binding預測，大規模搜尋，找出一些最有機會成為抗 2019-nCoV 的已在市面上的藥 [4]，其中前幾名，💊lopinavir & ritonavir (為 艾伯維 AbbVie 的抗愛滋病毒藥，商品名 Kaletra) (作用是 bind 並抑制 HIV的 protease，使病毒的 polyprotein 無法被切割成為 有功能的 proteins而被抑制) 。且 lopinavir & ritonavir 在當年 SARS爆發時曾被拿出來研究是否可以 in vitro 抑制之，結果可以 [5]。接著中國41位SARS病患施給此藥物後，體內病毒量降低、免疫系統也較控制組活化 [5]！而武漢病毒也是有蛋白需要被 protease 切開，因此也在 off label use情況下，約五天前在武漢直接用在病人身上，目前還沒有發表結果，不過感覺很有希望哦。

‼️Virus origin
可能因為上面愛滋病毒藥的事件，導致一堆人又說起中國改造病毒當生化武器。昨晚一篇線上發表 [6] 更把風向帶到這個陰謀論，害我還花時間去研究.... 這篇尚未 peer reviewd 的線上論文，是印度人做的。 2019-nCoV 既稱為新型冠狀病毒，他跟其他 family members 差異最大的地方就是 genome 中間的 spike protein區 [7]，印度團隊宣稱他們把這段拿去資料庫 BLAST，得到愛滋病毒 HIV 的序列 hit (且是結合免疫細胞的重要蛋白)，宣稱找到武漢病毒 4個 insertions，是其他冠狀病毒沒有 而HIV有的。這篇研究直接導出結論是，不太可能是自然發生而是人為??!.....陰謀論加上扯到愛滋，大家都嚇壞了

不過我實際去將整段，或是他宣稱的短的 motif 去做 BLAST.. 根本找不到 HIV 序列.. 還有在很多細菌或其他生物都能找到一樣的序列...且根本太短 四片段都是 6-8個氨基酸而已。 所以那篇方法應有問題、結論根本粗糙，愛滋病毒跟武漢病毒的連結就只有都會使用到 viral protease而已。然後他們究竟怎麼 BLAST到 HIV的呀？

‼️Diagnosis
目前要診斷 2019-nCoV 的方法只有使用 RT-PCR檢測，必須採樣後送至實驗室，耗時 5-6小時，如果加上排隊或運送（或有時湊不滿一次上機一盒試劑的量而要等待），就可能 24小時以上才知有無感染。所以大家都在開發更即時的方法。昨天 UCSF 與 Mammoth Biosciences (就是 CRISPR應用發明者之一 Jennifer Doudna開的，用 CRISPR核酸配對來偵測病毒 的公司) 宣稱他們已開發用 CRISPR技術 在兩小時內檢測出武漢病毒 [8]！並且是 point-of-care 也就是用試紙或其他方式，在採樣地點（診間、機場、救護車等）就可以測完＋看結果。當然其他大小公司也拼命發新聞稿，不論是開發疫苗、療法或是檢測方法，非常多的研究，希望可以遏止住疫情以及強化科研發展....

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ref
[1] First Case of 2019 Novel Coronavirus in the United States. NEJM. Jan 31, 2020.

[2] A Randomized, Controlled Trial of Ebola Virus Disease Therapeutics. NEJM. Dec 12, 2019.

[3] Coronavirus Susceptibility to the Antiviral Remdesivir (GS-5734) Is Mediated by the Viral Polymerase and the Proofreading Exoribonuclease. mBio. Mar 6. 2018

[4] https://innophore.com/2019-ncov/

[5] Role of lopinavir/ritonavir in the treatment of SARS: initial virological and clinical findings. Thorax. 2004; 59: 252-256

[6] https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.26.920249v1

[7] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. THE LANCET. Jan 30, 2020

[8] https://www.sfchronicle.com/…/Coronavirus-UCSF-expert-worki…

(最新幾篇研究可能未經同儕審查，應持保留態度)"