【打開「新冠病毒」的潘朵拉盒子】
2019年11月17日,中國湖北省武漢市一張胸部電腦斷層掃描(CT)影像出現毛玻璃狀結節(nodule),疑似新型肺炎病例,病因成謎。隨著年關將近,人們在12月開始頻繁奔波各地,武漢市位居中國交通樞紐,陸續發現數起新型肺炎的病例。疫情似乎悄悄蔓延。
同年12月30日武漢中心醫院醫師李文亮透過網路社群通知同事,華南海鮮市場出現類似嚴重急性呼吸道症候群(SARS)的病患,應小心防護。不幸的是,李文亮醫師因這種新型肺炎於今年2月7日病逝於武漢金銀潭醫院。
英國醫學期刊《刺絡針》(Lancet)特別於2月18日發文悼念李文亮,引述了美國約翰霍普金斯大學彭博公衛學院主任英格勒斯比(Tom Inglesby)的一句話:「世界上最重要的預警系統是,醫護人員意識到某種新疾病正在出現,然後發出警報。」
醫學界現在清楚知道這種新疾病是由人傳人的新冠病毒(SARS-CoV-2)所引起,命名為嚴重特殊傳染性肺炎。但人們太晚意識到「吹哨人」發出的警報,低估新冠病毒的傳染力,疫情迅速從中國傳到新加坡、韓國、日本等亞洲區域,蔓延到歐洲地區(特別是義大利以及西班牙),再擴散至美洲地區(美國紐約成為重災區),死亡和感染病例以指數型曲線與日俱增,人類正面臨21世紀的瘟疫[1]。
■什麼是病毒
病毒是一種寄生在於細胞內的微小生物體,感染的對象涵蓋細菌、古菌和所有的真核生物。病毒的構造極為簡單,主要包括四層結構,由內而外依序為:位於核心的遺傳物質、蛋白質構成的衣殼、源自於宿主細胞膜的脂質外套膜、以及具有宿主專一性的特殊蛋白質。
某些病毒的構造甚至更為精簡,不具有外套膜。由於缺乏複製遺傳物質與合成蛋白質所需的材料和環境元素,病毒的生存繁殖需要完全仰賴宿主細胞;而脫離細胞體的病毒,其活性可以維持數分到數小時不等。
目前已知的病毒種類共有489種病毒,因病毒具有高突變率,衍生出的亞種通常具有不同程度的感染力和致病性。除此之外,病毒毒性的差異亦見於不同的宿主物種間。隨著自然環境變遷的壓力與日俱增,似乎也加速了病毒演化的時程:擴大感染的物種範圍以及產生新種病毒。
以近數十年來侵襲人類的新變異株或新種病毒為例,有些已經成功地潛伏在人類的群落裡(如:愛滋病毒);而毒性強的新變異株(如:伊波拉病毒、 SARS病毒),則以低致病性的形態潛藏於原始的宿主物種當中。這些現象投映出病毒演變的縮影,也展現了病毒病絕佳的可變性和適應力。
病毒的起源現今仍未有定論,若從部份病毒基因的相似性橫跨了原藻以至於脊椎動物的角度來看,病毒可能是演化上最原始的生命形態;然而,另一種說法是:細胞的基因組意外地分割出可以獨立複製的基因片段,形成病毒顆粒的前身。無論如何,可以確定的是,精巧詭變的生存策略足以讓病毒成為演化長河中最淵遠流長的物種[2]。
■病毒與人
傳染病的流行,常常會影響人類的所有活動。歷史上的社會榮枯、文化起落、宗教興滅、政體變革、產業轉型、科技發展,都和傳染病的流行有密切的關係。戰爭的勝敗也可決定於傳染病的蔓延。在中世紀的圍城戰爭中,曾經將黑死病患者的屍體當作武器,以強力彈弓拋擲到城堡裡,讓守城敵軍得病死亡,進而不戰而勝。
■影響人類至巨的流行病毒
當新種病毒出現時,所有人類對它都沒有抵抗力,一旦傳染開來,流行就大為爆發,使得民眾陷入一無所知的高度恐慌當中。像二十世紀的多次流行性感冒、愛滋病和狂牛症等,在擴散蔓延的初期,帶給人們極度懸疑的不確定性和不安全感。
一直等到醫學界闡明了感染途徑及擴散風險、重症與致死比例、易感受宿主特徵、病原體真面目、有效防治措施之後,人們才逐漸消滅心中的不安[3]。
■會感染人類的冠狀病毒
會感染人類的冠狀病毒包括:引起輕微症狀的人類冠狀病毒OC43、HKU1、NL63、229E,以及引起嚴重症狀的中東呼吸症候群冠狀病毒(MERS-CoV)、嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒(SARS-CoV)、新冠病毒。
從基因組分析可發現,新冠病毒與SARS病毒基因相同度約有80%,複製酶的胺基酸序列相同度達到94%,表明這兩種病毒屬於同一類;而新冠病毒與中國雲南當地的中華菊頭蝠(Rhinolophus affinis)冠狀病毒RaTG13整體基因相同度更達到96%,代表演化關係更接近。
但如果比較與感染細胞直接相關的棘蛋白(spike protein)基因組,新冠病毒與中華菊頭蝠(Rhinolophus affinis)冠狀病毒RaTG13的相同度高達93%,與SARS病毒的相同度卻只有75%左右,因此科學家已排除新冠病毒與SARS病毒的同源關係[1]。
■病毒是比人類更高級的存在!
科學家們尊稱為「冠狀病毒之父」的中研院院士、病毒學家賴明詔在 30 年前開始投入冠狀病毒研究,那時冠狀病毒被認為只是「感冒病毒」,研究的人少,非常冷門,連申請研究經費時,他都要再三強調「冠狀病毒未來會很重要」,才能順利過關。
直到 2003 年,亞洲地區爆發 SARS 疫情,才讓冠狀病毒成為病毒學研究的大熱門,更發現這或許是對人類最有威脅性的一種病毒。賴明詔院士直言「人類不可能比得過病毒,冠狀病毒比冠狀病毒學家還要聰明,病毒一定有很多奇妙的方法,可以把不可能的事情變成可能。」
■賴明詔院士:「永遠會有新興病毒出現」
病毒可以分成 DNA 病毒、RNA 病毒 2 種,DNA 病毒在複製的時候,需要複製雙股的基因,還要經過轉譯的作用;所以速度比較慢、也比較不容易突變、進化,相對來說是比較好控制的病毒。
但 RNA 病毒只有單股,複製速度快、又容易突變,相對來說比較難控制,像是愛滋病病毒就是 RNA 病毒,它也是世界上最難治療的疾病之一。
賴明詔院士說,而冠狀病毒又是 RNA 病毒中,最特別的病毒。「它有世界最長的 RNA 基因,有 3 萬個鹼基(承載基因的單位),理論上這樣的基因不應該存在,因為 RNA 複製時常常會出錯,所以超過 1 萬個鹼基之後,很多基因就會失去功能。但冠狀病毒可以遠遠超過這個數目,必然有個改變,可以去彌補出錯的問題。」賴明詔院士說。
而這次的新冠病毒又比以往的 SARS 傳播力更強,賴明詔院士說,「新型冠狀病毒跟 SARS 的病毒是很相近,但病毒受體的附著力將近高了 20 倍,可能是因為這樣所以傳播力很高,這是非常、非常奇怪的,我們以為新的病毒突變以後不會附著在受體,但附著力反而增加這麼多。」
在這樣的狀況下,賴明詔院士說,不管是動物跟動物接觸、還是動物跟人接觸,都可能產生出新的病毒,「只要接觸越來越多,我相信這個新的病毒會不斷的、繼續產生,而且會持續演化。」
■蝙蝠是冠狀病毒最重要的動物關鍵
跟冠狀病毒最緊密連結的動物,其實是「蝙蝠」。雖然很多動物身上都會帶有冠狀病毒,但目前觀察到的動物,只有蝙蝠可以跟冠狀病毒完全和平相處。
台灣病毒學權威、研究病毒數十年的徐明達教授說:「因為蝙蝠本身有很多可以抑制病毒發展的因素,一個是牠會製造很多干擾素,抑制病毒的發展,但是製造太多干擾素會影響細胞的活性,讓感染更厲害;但冠狀病毒在人身上,不會引起干擾素的製造,而蝙蝠有另外一些因素,很多干擾素也不會影響細胞。」徐明達教授說。
再加上蝙蝠的壽命很長,有的甚至可以存活四十年,種類又多、因此會帶有變種的病毒,同時數量也很多,病毒產生也多,所以影響的範圍也特別的大。
徐明達教授說「所以蝙蝠可以帶著病毒到處飛,到處去接觸(感染別人)」,但人類直接接觸到蝙蝠的機會很少,即使接觸也不容易直接引起突變,雖然(新冠病毒)跟蝙蝠定序有 96% 相似度,其中最重要的細胞受體的蛋白質不一樣,所以一定是有經過別的動物,經過變化,才變成新冠病毒。」
「這就是中間宿主。」林口長庚副院長、也是感染科醫師的邱政洵說,「冠狀病毒的自然宿主是果子狸跟蝙蝠,病毒接觸到中間宿主可能會停留一下,再傳染給人,但因為人不是自然宿主,病毒不會跟我們共存傳很久,所以之前像是 SARS、MERS 才會被控制住。」
所以邱政洵醫師很樂觀的認為,只要人類控制好跟動物的界線、不要輕易接觸野生動物、不要侵犯動物的領域,保持防疫觀念,新冠病毒還是有機會可以完全消失[4]。
2003年,SARS來襲。相隔17年後,新冠病毒帶著超強的感染力襲捲而來,現代文明社會遭受前所未見的打擊,幾乎全面停擺。面對不斷演變的新冠病毒,科學家在基因組定序、結構生物學、公衛及流行病防治等領域有了長足的進步,在短短數個月內,我們已能一窺新冠病毒的面貌及作用機制,同時擬定治療策略。
即使潘朵拉的盒子已經打開,這些無價的科學研究讓我們面對疫情時不會一籌莫展。在黎明來臨之際,世界必須團結一致,共同對付這個危險的敵人,相信不久之後,我們能戰勝這場嚴峻的瘟疫[1]。
【Reference】
1.來源
➤➤資料
[1] 《科學人》粉絲團「打開新冠病毒的潘朵拉盒子」:https://bit.ly/3BM5a9e、(Yahoo新聞)https://bit.ly/2YkoITx
[2](臺灣醫學會)「什麼是病毒」:http://www.fma.org.tw/2009/bio-1.html
[3](國研院國網中心 )「病毒與人-從SARS的流行談起 (▸演講人/陳建仁) (科學發展 2003年6月,366期)」:http://science.nchc.org.tw/science/science2005/Papers/c4academician/9206-08.pdf
[4](Heho健康)「病毒是比人類更高級的存在!台灣 4 大病毒學家:新病毒會不斷產生,只求和平共存」:https://heho.com.tw/archives/93282
➤➤照片
[1]科學家揭露新冠病毒基因組和棘蛋白胺基酸序列,探索其感染機制。
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同時也有69部Youtube影片,追蹤數超過646的網紅中央研究院研之有物,也在其Youtube影片中提到,我們的動機是如何形成的? 大腦如何操縱飢渴的行動? 果蠅腦中有一種名為 leucokinin 的神經傳導物質,它能調控不同的神經細胞,影響果蠅進行覓水或覓食的行為,更發現渴、餓的神經機制在果蠅腦中會交互作用,研究成果已於 2019 年 10 月登上《自然: 神經科學》(Nature Neurosci...
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#9月國際失智症月
#阿爸忘記正在煮開水了
#阿公忘了怎麼回家
#阿嬤連我是誰都忘了 😥😥
失智,是許多家庭的痛,照顧者心痛,長輩隨著記憶退化,往往也陷入惶恐不安。然而,大腦到底發生什麼事,讓我們記憶退化、反應變差?
中研院生醫所陳儀莊特聘研究員說明,記憶的形成和維持,都依賴 #神經網絡 順利運作。當大腦的神經細胞 #無法順利代謝壞蛋白質,蛋白質持續不正常堆積,就可能造成失智、漸凍症。
但,為何神經細胞會無法順暢「倒垃圾」?
關鍵就在於 #腦脊髓液流通不順暢。而科學家在小鼠實驗中發現,腦脊髓液的流通,不只跟 #年齡 有關,還跟 #睡眠 密切相關!🧓👵💤
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🌙讀完決定今日不熬夜🌙
https://research.sinica.edu.tw/neuron-disease/
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#免費公開課 #Zoom線上進行
【準哈佛、劍橋、MIT 生齊聚一堂的英語學術寫作課】
前陣子收到了現在在 #美國芝加哥大學 求學的學生的一封信。該生學的不是什麼簡單的科目,是芝大製造出最多諾貝爾獎得主的社會科學領域。
信中她對於前年在我的 #學術英文寫作課 中所學到的東西,表達了滿滿的感謝。她現在已經是芝大的助教,指導學生甚至包含了好多芝大的美國人。
我的學術英文寫作課中,常常臥虎藏龍。
✔︎ 有接下來要到 CMU、MIT 念電腦科學的準碩士生們、
✔︎ 有要到劍橋、牛津唸生化、物理的準碩博士生們、
✔︎ 有在 UCLA、NYU 念大學,中間回來加強寫作的學生
✔︎ 也有在中研院研究公衛的研究員,甚至也有
✔︎ 在台大醫院、北榮等教學醫院,邊執業、邊協助做醫學研究的醫生們
從商業分析 (BA) 到經濟學、心理學、哲學, 從公共衛生到化學、物理、電腦科學、土木工程,#不分領域,他們都在努力將學術寫作學好因為這項能力,在他們的生涯裡頭扮演著極為關鍵的角色。
✔︎ 你知道 literature review 要怎麼寫嗎?
✔︎ 你知道學術寫作文法跟一般文法的差異嗎?
✔︎ 你知道 paraphrasing skills 不只是換換同義字、主被動改變嗎?
✔︎ 你知道比起 cite 文獻, 對該文獻的 elaboration 更重要嗎?
在 9/28 (二),我將用帶來一場 #學術英文寫作公開課。名額有限,請到下方活動通 link 完成報名,公開課前將 email 公開課的 zoom link。
時間:7:30 - 8:30 pm
地點:參照當日寄出的 zoom link
一秒報名:https://www.accupass.com/event/2107030310471117652660
(我另外有商業寫作課程,若沒有學術英文寫作需求,請留機會給有需求的學生,感謝您!)
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我們的動機是如何形成的?
大腦如何操縱飢渴的行動?
果蠅腦中有一種名為 leucokinin 的神經傳導物質,它能調控不同的神經細胞,影響果蠅進行覓水或覓食的行為,更發現渴、餓的神經機制在果蠅腦中會交互作用,研究成果已於 2019 年 10 月登上《自然: 神經科學》(Nature Neuroscience)
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研究員運用一種 T 字狀迷宮「T-maze」,先讓果蠅渴 8 個小時,然後進入 T-maze ,通入氣味 A、不給水 (放置乾燥的濾紙),持續 2 分鐘。間隔 1 分鐘後,再通入氣味 B 、給水喝 (放置潮濕的濾紙),持續 2 分鐘,訓練果蠅將氣味 B 與水連結起來,訓練就完成了。訓練完成 6 小時之後,將渴的果蠅放入 T-maze,大多數乖乖進入 B 氣味通道。
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資料來源:中研院分子生物研究所,林書葦提供
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閱讀全文〈「大腦如何操控渴與餓的行動?小小果蠅來解密! 〉
https://research.sinica.edu.tw/lin-suewei-fly-brain-thirst-hunger/
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#記得打開CC字幕 #黑洞現身的一周
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各節重點:
00:20 【臺灣焦點】
03:16 【國際關注】
07:02 【趣味集錦】
09:18 結尾
09:40 掰比~別忘了訂閱!
【 製作團隊 】
|企劃:土龍
|腳本:土龍、力寧
|剪輯後製:Pookie
|剪輯助理:夯吉
|演出:志祺
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【 本集參考資料 】
→ 黑洞影像如照片失焦?孫維新解答科學家感動的原因:https://bit.ly/2U9vkME
→ 8座電波望遠鏡捕捉黑洞 我負責3座/中研院另還負責資料成像處理、黑洞模型電腦模擬:https://bit.ly/2Ill6aU
→ 事件視界望遠鏡(Event Horizon Telescope,EHT)全球記者會:https://bit.ly/2PdCTRY
→ https://bit.ly/2P7MGbW:What are black holes? WIRED explains
→ SCIENTISTS HAVE PEERED INTO A BLACK HOLE AND TAKEN A PHOTO OF ITS EVENT HORIZON FOR THE VERY FIRST TIME:https://bit.ly/2DeR3xk
→ The first-ever photo of a black hole is expected very soon:https://cnn.it/2KAHte3
→ 遣返武統學者李毅 總統府:支持依法處理:https://bit.ly/2Pb9VSL
→ 李毅:韩国瑜颂:https://bit.ly/2GeKtYd
→ 李毅:再论和平统一已无可能:https://bit.ly/2V0nmtU
→ 盧秀燕Facebook:https://bit.ly/2PaIB72
→ 獨/深夜已與移民署聯繫 李毅:一秒鐘都不想待台灣:https://bit.ly/2PdAeHN
→ 中市府駁警車開道 中國和平統一促進會:已刪除:https://bit.ly/2Z7b1mK
→ 台中「和平統一」大遊行喊卡,台灣統促會和中共是什麼關係?:https://bit.ly/2ZcTLwt
→ 413護台抗中!反制統促台灣人站出來!:https://bit.ly/2UP9YIT
→ 釋字第 445 號:https://bit.ly/2V1yXZH
→ 集會遊行法 :https://bit.ly/2GmMcMD
→ 非洲豬瘟資訊專區:https://bit.ly/2VKiJ4v
→ 台灣廠商研發非洲豬瘟「快篩試劑」,獲OIE驗證是亞洲第一:https://bit.ly/2V3KxDT
→ 非洲豬瘟0410》中國海漂豬屍一直來,連日出現已達五例!農委會:中國疫情嚴峻:https://bit.ly/2GpjquQ
→ 蘇丹政變:鐵腕總統下台軍隊接管的前因後果:https://bbc.in/2ZbVq5z
→ 蘇丹政變:「種族滅絕罪總統」巴席爾遭軍方逮捕,結束30年獨裁:https://bit.ly/2ZbDA2G
→ 利比亞內戰升高 叛軍爭奪首都之戰已釀121死:https://udn.com/news/story/6809/3755345
→ 圍城的黎波里!利比亞內戰3.0,「東西軍」交戰美軍撤兵:https://bit.ly/2V6316J
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→ 市场监管总局部署开展“守护消费”暨打击
侵害消费者个人信息违法行为专项执法行动:https://bit.ly/2VT7Jl2
→ 演算出史上首張黑洞照片 29歲科學家成焦點人物:https://bit.ly/2Z2fTdb
【 延伸閱讀 】
→ 人類首次拍得黑洞照片 再證愛因斯坦廣義相對論:https://bit.ly/2Df80Ye
→ 把望遠鏡搬到格陵蘭?!觀測黑洞的瘋狂天文學家:https://bit.ly/2G58O2x
→ How Katie Bouman Accidentally Became the Face of the Black Hole Projec:https://nyti.ms/2D9Wr4B
→ Israeli settlements, explained | Settlements Part I:https://bit.ly/2PbpM3m
→ How to take a picture of a black hole | Katie Bouman:https://bit.ly/2FKyYYu
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雖然試算表軟體是因應商業應用而發展的,但在科學上已廣為應用,而「商業智慧」軟體(BI)是另一個適合做科學應用的工具。越早熟悉BI軟體的使用,就能越早利用大數據。面對大數據的分析,需要先利用視覺化分析找到線索後,再找證據驗證想法。所以中研院統計所的陳君厚所長曾說「學習可以做什麼,有助於在資料分析的過程中達到事半功倍的效果」。請跟著我們一起來透過實際操作,體驗如何做「探索式資料分析(ExploratoryDataAnalysis)」吧!
本次課程將分成基礎與進階訓練,課程中將會使用全校免費授權使用的PowerBI工具。利用其內建的視覺效果及自訂視覺效果群組,讓您可以建立出色的報表。
日期:2017年8月16日及8月23日(星期三)下午13:30~16:30
地點:陽明大學圖資大樓4樓401室電腦教室(座位50位)
課程簡介:認識大數據、大數據分析、資料視覺化、分群、預測與發布結果,讓數字說話,提升管理品質,有效提升工作效率。
內容大綱:
8/16(三)生醫大數據分析-基礎訓練
1.認識PowerBI、
2.連接到數據、
3.可視化分析、
4.繪製地圖、
5.新增欄位、
6.儀表板201
8/23(三)生醫大數據分析-進階訓練
1.可視化分析
2.計算入門
3.分群、預測與管理
4.儀表板
5.視覺效果
6.分群
7.預測
8.發布與分享成果
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[台北] 中研院徵心智腦科學研發替代役專任研究助理
【公司名稱】 中央研究院統計科學研究所
【工作職缺】 碩士級研發替代役專任研究助理
【工作內容】
1. 協助心智科學腦電(磁)波、腦影像研究計畫執行,紀錄與分析功能性磁振造影、腦電(磁
)波資料。
2. 協助實驗室行政事務與臨時交辦事項。
3. 需有動機與能力主動學習實驗之紀錄執行及腦電(磁)波、腦影像訊號分析處理等相關技
術。
4. 需參與實驗室之研究討論與閱讀文獻。
【徵求條件】
1. 電機、醫工、資訊或其他理工生物相關領域,需有程式設計能力並有良好程式註解風格
習慣者。
2. 對大腦研究議題與工具有興趣, 具主動、積極、認真、負責、好相處的態度優先考慮。
3. 需精熟 Matlab 程式設計,若有 jquery, python 設計實務者尤佳。
4. 具備基本統計能力,有工程數學背景尤佳。
5. 英文能力良好。
【工作地點】 中央研究院統計科學研究所。
【工作時間】 週一至週五每日八小時,視實驗需求於晚上或假日施測,可彈性調整工作時
間。
【月休】 週休二日
【薪資範圍】 比照科技部專任助理人員標準。(碩士級第一年月薪36,050)
【需求人數】 1人
【聯絡人/連絡方式】 意者請備齊:
1. 履歷 (含正面照片,請說明申請本工作的動機)
2. Matlab 程式設計及其他相關能力證明文件
3. 註明詳細聯絡方式 寄至 E-mail: [email protected] (蔡老師)
郵件主旨請用:"姓名 + 應徵研發替代役專任研究助理"。
【其他備註】
1. 基本上適合者將儘早通知面談,不合者恕不通知亦不退件。
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