午夜加場！黃立民老師上課！ 2020.3.5
今天阿中很辛苦晚上加場，我也來加場XD
我對於近日有報導新冠病毒演化出L和S兩個亞型的新聞很在意，所以來整理一下。
背景：
1.中國科學院於3月3日發表論文《關於新冠病毒的起源和持續進化》，對全世界各地上傳的103個新冠病毒全基因組進行分析，發現新冠病毒已經演化出L和S兩個亞型。103株中101個屬於這兩個亞型。
2.許多侵襲人類的冠狀病毒來源都有可能是蝙蝠。S亞型和蝙蝠的冠狀病毒在演化樹上更接近，預測S亞型是相對較古老的。L亞型則比較新。
3.從佔比上看，L亞型更為普遍達到70%，S亞型佔30%。
4.以時間序來看，L亞型則在武漢爆發的早期階段更為普遍，而L亞型的發生頻率在2020年1月初後有所下降。
5.根據以上發現，作者推論，人為的感控措施干預可能對於L亞型有了壓制的效果。雖然他是比較新的病毒，猜測毒力還有傳播力可能都較高。
S亞型比較原始，毒力還有傳播力可能較低，但因為受到的選擇壓力相對較弱，後來反而比例比較多。
黃立民老師：
1.新冠病毒是RNA病毒（相對於DNA病毒，RNA病毒比較不穩定），一直在傳播的過程中會產生變異。
2.L和S兩個亞型是一個胺基酸不同，這似乎會改變傳染效率和疾病嚴重程度。
3.一開始是傳染效率比較高的，疾病嚴重程度比較高的L亞型佔優勢。但後來這變成劣勢，因為這種病人很容易被辨識而隔離起來，就不容易傳。
4.一旦人為介入，比較低調的S亞型反而佔優勢（傳染效率比較低的，疾病嚴重程度比較低的）。S亞型傳得稍慢，臨床上比較安靜，症狀比較輕微，目前就變多了。
5.目前突變的位置不在PCR偵測/藥物或疫苗研發的重要位置上面。
小璧子補充：
1.其實S亞型和L亞型到底傳染效率和疾病嚴重程度怎樣，是作者的猜測。這篇研究其實沒有結合流行病學和臨床資料。這完全是推論。
2.我個人的推測：我同意L亞型疾病嚴重程度可能較高，這可以解釋武漢一開始看到的高致死率，然後出了武漢很多地方致死率似乎就沒這麼高。
但我會猜測S亞型傳染力不一定比較慢。輕症多無症狀多讓他更容易傳播，讓他在武漢封城前被諸多輕症者帶出武漢，散到全世界。
3.世界各國流行的亞型很可能也有所不同，可能可以部份解釋為何在伊朗，義大利的致死率較高。
4.這麼短時間病毒就變異了會令人擔心。你可能會擔心，會不會在台灣流行的病毒株忽然又變成疾病嚴重程度高？
生命會找到出路。長久看下來，病毒通常會往和人類和平共存的方向演化，這樣的病毒才容易常存在人類世界。如果太毒的，宿主太快就住院被隔離甚至死亡，病毒根本傳不出去。這點倒是不用太擔心。
