26歲就成為大學教授的天才!她大膽讓AI與生物學「夢幻聯姻」,為何讓貝佐斯都想投資?
2020.11.11 by 邱品蓉
26歲就成為史丹佛大學教授的Daphne Koller,利用人工智慧與生物學,在一片新興產業中嶄露頭角,讓貝佐斯也想來投資她!
人工智慧(Artificial Intelligence)的運用在現今已非常廣泛,在商業活動方面尤其司空見慣。然而,有位來自史丹佛大學的教授達芙妮.科勒(Daphne Koller)大膽革新,把人工智慧和生物學做結合,並利用數據分析,執行新藥研發計畫。
曾經獲得麥克阿瑟(MacArthur)天才獎的達芙妮,26歲時就成為史丹佛大學的教授,還是遠距教學平台Coursera的共同創辦人。她在2016年時離開Coursera,並於2018年時,創辦了Insitro。
用人工智慧分析潛在治療方法,若成功可降低新藥研發成本
Insitro透過電腦科學專家和生物學家的協力合作,結合機器學習和基因組合,創建自定義數據,機器會在臨床數據庫中找出學習模式,隨後,人工智慧將會利用這個模型,分析出潛在的治療方法,利於新藥開發,並提出測試建議。
達芙妮的創新作法若是成功,將可大大降低新藥的研發成本和時間,原先要耗費好幾年反覆實驗測試的新藥,或許能夠在幾週的時間內就研發完成。
許多人不禁會納悶,這些臨床數據究竟從何而來?和其它數個同期成立的對手公司不同,達芙妮投入大量的資金,打造專屬Insitro的數據庫。因此該公司內部組成不乏各種背景的員工,除了發展機器深度學習的專家外,還有專門進行研究的實驗人員。
達芙妮則每天在不同的領域間穿梭,上一刻還在名為「白血球」的實驗室,下一刻她就晃到「數據建模技術」的辦公室中。
「這樣的平台並非魔術。」達芙妮表示,人工智慧並不會讓生物學變得更簡單。但她也認為,只要有足夠的數據基礎,機器學習將得以完成非常令人驚豔的成就。
藍海中的新興產業,連貝佐斯也成為Insitro的投資人
2019年,Insitro和生物製藥公司吉利德(Gilead)簽署了一項協議,Insitro得以使用吉利德的臨床實驗數據,幫助吉利德研發治療肝臟的藥物,此項合約的預付款為1,500萬美元,若是成功,預計將可以帶來約10億美元的進帳。
吉利德公司肝臟疾病臨床研究負責人Mani Subramanian,十分肯定達芙妮的專業。Subramanian說:「同時熟悉生物學和機器深度學習的專家十分稀少。」
對於Insitro這鮮為人知的新興產業,市場上的投資者反應卻非常熱烈。在達芙妮成立Insitro後,短短六個月的時間,她就從Alphabet、Foresite Capital、GV和Third Rock等公司募集一億美元的資金,不久之後,貝佐斯也跟著加入投資者的行列。
在《富比士》首屆AI 50的榜單上,Insitro是其中擁有最高資金的醫療初創公司。達芙妮認為對投資者而言,人工智慧和生物學的結合,可以說是「天堂般的婚姻」。
達芙妮表示,未來她不排除和一些大型製藥公司建立夥伴關係,但最終的目標是創立自己的藥廠品牌,從開發到監管批准,成為全面性的大型藥廠。「我們不是只想建立一間小型的新創公司,而是在建立一間足以扭轉整個藥物產業生態的大型製藥公司。」達芙妮對於Insitro如此期許。
資料來源:https://www.bnext.com.tw/article/60016/insitro-drug-discovery-ai-daphne-koller?fbclid=IwAR1FIh8ule30tFjD85RTPYofzXQgW5-BErwX52sbeRMnLbay5l1zvN8IAMw
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新藥研發成本 在 李開復 Kai-Fu Lee Facebook 的最佳貼文
本文來源創新工場微信公眾號
Alex是一名不同尋常的科學家,他是為數不多的既懂醫學又懂AI的科技創業者。
2014年,Alex創立了Insilico Medicine,現在已經成為了AI+醫療賽道上的頭部玩家。他的創業實踐,證明了AI+醫療的的巨大潛力。
傳統新藥研發像是一場冒險、漫長的豪賭:10年以上研發週期,30億美元左右的研發費用,以及高達92%的失敗率。
使用AI助力,Insilico希望做一個“綜合格鬥家”,將新藥研發週期壓縮在兩到三年內,同時大幅降低成本和失敗率。
▍新藥研發是一場豪賭
新藥品的研發,是一個極度複雜、冒險和漫長的過程。
在2010年,研製一款新藥需要花費17-18億美元,現在需要30億美元。儘管技術在進步,新藥研發成本卻越來越高。
經常出現的情況是,從業者提出了一個治療疾病的假說,但卻沒能看到產品上市,因為新藥研發從想法到藥品生產往往需要10年以上,並且有著高達92%的失敗率。
新藥研發步驟繁瑣,耗財耗時
有80%的可能性,是花了一年時間還沒有找到標靶的治療元素;有75%的可能性,是又花了一年半找到了治療元素,然後再花兩年時間優化它,從識別到優化就過去了四年半。
和人臉識別AI相比,藥品研發AI有非常大的區別。第一是驗證結果的時間特別長,所以大部分都以失敗告終。第二是沒有足夠的成功案例去訓練模型,所以我不得不經常抽自己的血,來快速驗證一個假設。
更糟糕的是,在制藥行業中,藥物發現和藥品開發通常不是一撥人,因為這兩個領域是不相連的。所以當引入新技術時,一旦無法同時與這兩個領域相融,時間成本就會成倍增加。所以很多人認為AI改變醫療行業,可能需要25年。
10年到25年,很少有藥企願意承擔這樣的豪賭。這也是為什麼聽說AI技術時,很多藥企持懷疑態度,因為他們已經聽過太多所謂的新技術,而這些新技術都失敗了。
▍醫療AI要做“綜合格鬥家”
上世紀90年代,人們總喜歡爭論,哪種武術流派才是最棒的。實際上,要成為冠軍,你需要更善於近身搏鬥、拳擊、腳法,甚至要精通摔跤技巧,要做一個“綜合格鬥家”(MMA)。
新藥研發從業者也要成為一個「綜合格鬥家」:你要善於識別目標,要緊密聯結生物和化學,要快速設計分子去扼殺目標,要精准預測臨床試驗的結果。
然而,上述所有步驟,在當下的藥物研發中都是割裂的。
Insilico Medicine正在做的,就是用“綜合格鬥家”一樣的AI,把這些步驟都統一起來,建立一套包括靶點識別、分子發現、臨床預測在內的端對端(end-to-end)新藥研發綜合解決方案。
我們尤其專注於靶點識別,使用病人的組學資料來發掘新的疾病靶點,當發現新的靶點後我們可以快速的運用生成化學深度學習模型來設計化合物驗證靶點的可靠性。
我並不是在說空話,Insilico目前已經在很多行業頂級雜誌上發表文章。就在最近,我們在Nature Biotechnology上展示了一個令人印象深刻的成果:
我們的合作夥伴藥明康德曾對我們進行考驗,為一個具有挑戰性的蛋白質靶點生成新的分子。這個挑戰以前需要4年半時間,而我們僅用21天就完成了,又在46天裏完成了一系列實驗驗證,而且命中率極高。
這種速度,包括實驗中使用的生成對抗網路技術、增強學習技術,都是具有革新意義的成果。
這就是我正在努力實現的夢想,相比於傳統的十年研發週期,我希望把新藥的研發過程壓縮在兩到三年的時間裏,然後快速治癒一種疾病。
新藥研發成本 在 李開復 Kai-Fu Lee Facebook 的精選貼文
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Alex是一名不同尋常的科學家,他是為數不多的既懂醫學又懂AI的科技創業者。
2014年,Alex創立了Insilico Medicine,現在已經成為了AI+醫療賽道上的頭部玩家。他的創業實踐,證明了AI+醫療的的巨大潛力。
傳統新藥研發像是一場冒險、漫長的豪賭:10年以上研發週期,30億美元左右的研發費用,以及高達92%的失敗率。
使用AI助力,Insilico希望做一個“綜合格鬥家”,將新藥研發週期壓縮在兩到三年內,同時大幅降低成本和失敗率。
▍新藥研發是一場豪賭
新藥品的研發,是一個極度複雜、冒險和漫長的過程。
在2010年,研製一款新藥需要花費17-18億美元,現在需要30億美元。儘管技術在進步,新藥研發成本卻越來越高。
經常出現的情況是,從業者提出了一個治療疾病的假說,但卻沒能看到產品上市,因為新藥研發從想法到藥品生產往往需要10年以上,並且有著高達92%的失敗率。
新藥研發步驟繁瑣,耗財耗時
有80%的可能性,是花了一年時間還沒有找到標靶的治療元素;有75%的可能性,是又花了一年半找到了治療元素,然後再花兩年時間優化它,從識別到優化就過去了四年半。
和人臉識別AI相比,藥品研發AI有非常大的區別。第一是驗證結果的時間特別長,所以大部分都以失敗告終。第二是沒有足夠的成功案例去訓練模型,所以我不得不經常抽自己的血,來快速驗證一個假設。
更糟糕的是,在制藥行業中,藥物發現和藥品開發通常不是一撥人,因為這兩個領域是不相連的。所以當引入新技術時,一旦無法同時與這兩個領域相融,時間成本就會成倍增加。所以很多人認為AI改變醫療行業,可能需要25年。
10年到25年,很少有藥企願意承擔這樣的豪賭。這也是為什麼聽說AI技術時,很多藥企持懷疑態度,因為他們已經聽過太多所謂的新技術,而這些新技術都失敗了。
▍醫療AI要做“綜合格鬥家”
上世紀90年代,人們總喜歡爭論,哪種武術流派才是最棒的。實際上,要成為冠軍,你需要更善於近身搏鬥、拳擊、腳法,甚至要精通摔跤技巧,要做一個“綜合格鬥家”(MMA)。
新藥研發從業者也要成為一個「綜合格鬥家」:你要善於識別目標,要緊密聯結生物和化學,要快速設計分子去扼殺目標,要精准預測臨床試驗的結果。
然而,上述所有步驟,在當下的藥物研發中都是割裂的。
Insilico Medicine正在做的,就是用“綜合格鬥家”一樣的AI,把這些步驟都統一起來,建立一套包括靶點識別、分子發現、臨床預測在內的端對端(end-to-end)新藥研發綜合解決方案。
我們尤其專注於靶點識別,使用病人的組學資料來發掘新的疾病靶點,當發現新的靶點後我們可以快速的運用生成化學深度學習模型來設計化合物驗證靶點的可靠性。
我並不是在說空話,Insilico目前已經在很多行業頂級雜誌上發表文章。就在最近,我們在Nature Biotechnology上展示了一個令人印象深刻的成果:
我們的合作夥伴藥明康德曾對我們進行考驗,為一個具有挑戰性的蛋白質靶點生成新的分子。這個挑戰以前需要4年半時間,而我們僅用21天就完成了,又在46天裏完成了一系列實驗驗證,而且命中率極高。
這種速度,包括實驗中使用的生成對抗網路技術、增強學習技術,都是具有革新意義的成果。
這就是我正在努力實現的夢想,相比於傳統的十年研發週期,我希望把新藥的研發過程壓縮在兩到三年的時間裏,然後快速治癒一種疾病。
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今天又是疫情變化的一天,讓我們來聽聽中華民國防疫學會理事長王任賢醫師怎麼看目前的疫情呢?
根據聯合報的報導:【台北農產運銷公司從6月21日至今,已經做了4933人快篩,其中偽陽性有15人,PCR檢測後4人確診。台北市長柯文哲認為「北農沒有你們想像得那麼可怕」,指出確診率不到0.1%。副市長黃珊珊表示,目前已經打了1700多劑疫苗,預計周五前造冊的4000多人都會打完,也強調公司造冊後就要負責任。】其實北農的老闆是農委會,所以看到好久不見的陳吉仲出來害我嚇了一跳,怎麼忽然跳出來,北農的群聚開始在五月中,難道這一個月之間中央都不覺得北農有可能產生嚴重後果嗎?不過目前北農要保持運作,一邊還要進行疫情管制,真的做得到嗎?我們請王任賢醫師來分享一下他的看法,到底北農應該要怎麼處置呢?
另外,北農的人流量一天可能高達兩萬人,又有各種來自各縣市的蔬菜水果,中南部真的都沒有受到更嚴重的影響嗎?
另外,王理事長在中國時報的投書中也寫了這次廣州的篩查十分有效率,目前這次DELTA病毒在廣州的狀況,和整體封鎖篩查的狀況到底如何,台灣能夠預先抄作業做好準備嗎?但這種強勁快速封城的狀況還是造成了國際航運的嚴重問題:【全球陷入塞港夢魘,全球第四大、中國大陸第三大深圳鹽田港的港區已正式通知所有的客戶,作業量逐漸恢復當中,最快要到6月底有望全部碼頭恢復作業。貨攬業者表示,原本要進鹽回港的貨大部分都還在排隊等進場,現在手上的貨都「滿出來」,到月底才能全面恢復,急單還是要拉到別港口出貨。】難道篩查沒有甚麼更容易的替代方案嗎?
另外,根據德國之聲今年五月的報導:【德國聯邦政府和各州政府週三經過馬拉松式的磋商後,制定了德國如何逐步解封的策略。其中一項重要內容是提供民眾免費快速篩檢的機會。預計自下周開始,聯邦政府將會承擔快速篩檢的費用。每人每週可以獲得一次免費檢測的機會,地點可能位於檢測中心、診所或工作場所,由受過訓練的人員執行。其中幼兒園保育員、兒童、學生和教師都是快篩措施的重點討論對象,以確保學校及幼兒園能保持開放。
德國衛生部長施潘(Jens Spahn)週四表示,德國已訂購至少2億份自我檢測試劑以及8億份快篩試劑,供應商目前有1.5億份存貨。自我檢測試劑的使用原理與快篩試劑相同,由鼻子或咽喉取樣,使用者可自行檢測,無需專業人員協助。】另外,今年五月開始,德國也修正了相關的逐漸開放的規定,【根據最新法規,疫苗接種者和痊癒者將無需提交陰性檢測結果,就可以出門購物、理髮或參觀植物園等等。除此之外,接種者和痊癒者還可以在私人空間不受限制地訪友會客。不過,完成兩劑疫苗接種14天後,上述取消限制的措施方可生效。】
另外,根據geneonline的報導,原先大受期待一堆人投資的CureVac竟然三期臨床實驗結果令人失望,連百分之五十都沒達到:【Pfizer/BioNTech 與 Moderna 的 mRNA 新冠疫苗是各國施打的熱門疫苗,德國藥廠 CureVac 同為 mRNA 新冠疫苗的開發商,雖研發速度偏慢,但因其疫苗儲存條件較佳與量產成本較低,仍具有與 2 大 mRNA 疫苗開發商競爭的潛力。然而,CureVac 最新出爐的第 2b/3 期期中臨床數據卻讓它失去了入場競爭的門票,抗輕度至重度的 COVID-19 有效性僅 47%,未達到預期標準。
臨床試驗 HERALD 招募了來自歐洲與拉丁美洲的 4 萬位受試者,並在共 13 種以上新冠變種病毒遍及的環境中試驗。結果指出,134 位感染 COVID-19 的受試者中,有 124 個案例源自變種病毒,其中 57% 受試者是受到高關注變異株(VOC)感染,也就是那些已有文獻證實能降低新冠疫苗與療法功效的病毒株;其它變種則包含 Lambda 變種病毒(C.37,祕魯)與於哥倫比亞發現的 B.1.621。】可是我們高端的疫苗感覺信心滿滿的ㄟ,都不會覺得自己三期有可能出問題嗎?
著名的喜劇演員李秉穎還在自由時報的訪問裡面表示:【李秉穎指出,這種攻擊就是「雞蛋裏挑骨頭」,先攻擊沒有三期、再攻擊審查委員,什麼東西都可以拿出來批評,但這真的對台灣民眾是好的嗎?國產疫苗如果不能如期上市,最高興的會是誰?他認為台灣防疫受挫,最高興的絕對不是台灣人民。】那全世界到底除了台灣之外有哪一個國家已經使用免疫橋接代替第三期認證疫苗,沒有的國家是不是都不認同台灣獨創的政策,對台灣不好?
另外,根據ettoday的報導:【國內從5月11日確認社區本土病例,疫情爆發以來已經累計超過1.3萬名本土,且有超過500例死亡。中央流行疫情指揮中心今日公布最新重症統計,有2444人屬於重症,當中大部分是60歲以上有1639例。60歲以上重症率達到35.8%。】根據中央社的報導,巴黎的研究數字:【這項刊登在刺胳針呼吸道醫學(Lancet Respiratory Medicine)期刊、使用全法國數據的研究強調,感染2019冠狀病毒疾病更為嚴重。研究人員將今年3月與4月8萬9530名因感染新型冠狀病毒住院病患的資料,與2018年12月至2019年2月底間4萬5819名因季節性流感住院病患的數據作比較。】在這份法國研究中,進入加護病房的比例是16.3%,而死亡率是16.9%,如果照這個數據來看,法國的死亡率比我們高,但我國的重症比例也還是比較高,到底有甚麼原因呢?
【call out新竹Justin】分享故事:
1. 帶爺爺奶奶和外公都施打過AZ疫苗了。爺爺和奶奶是我帶他們去打疫苗的,新竹市搞了一個大型戶外疫苗接種站;當天報到量體溫消毒、查驗證件(會特別對健保卡跟身分證以上都會過卡)、醫生問診打疫苗、休息30分鐘,其實過程還算順利。
打完疫苗後長輩其實都沒什麼狀況,但打疫苗前有請他們帶平常在吃的藥給醫生看確認沒問題才打,也有現場等30分鐘才離開但其實真的很多長輩根本不想等30分鐘打完就想走。
但是當問到第二劑疫苗何時能打時,護理人員則表示要看疫苗何時會到…
2. 三級警戒下身為一個碩士應屆畢業生說實在感覺我們被政府拋棄,疫苗沒我們的份、紓困沒我們的份、因為疫情有些職缺沒有再開了,但我們又能怎樣罵了政府會聽嗎?只會找專家學者來定紓困方案,但那完全不符合真實民間狀況啊。社會上20-40歲年輕人誰關心過我們?只有選舉喊出一堆打高空政策,實際上有哪個政治人物關心過我們。
20-40是台灣勞動力生產主要一群我們可能稅繳的沒有大老闆多,但付出勞力對國家貢獻總有吧?每個行業都說要優先打疫苗官員也跟民眾搶,我真的很希望國家沒有拋棄我們。
#王任賢 #北農 #疫苗
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香港今日社論2020年11月11日(100蚊獅子頭)
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明報社評
歐美新冠疫苗研究傳來好消息,美國輝瑞藥廠表示,他們伙拍德國生物科技公司合研的疫苗,有效預防率超過九成,市場反應亢奮,憧憬經濟復常,然而全球抗疫之路仍然漫長,以為疫情快將終結是一廂情願。輝瑞疫苗免疫效力有多久,目前並不清楚,生產瓶頸等問題亦需克服,內地研發的多款新冠疫苗,亦面對類似情况;即使技術問題一一克服,歐美還要面對反疫苗運動,美國很多人篤信疫情陰謀論,拒絕戴口罩,遑論接種疫苗,就算有足夠疫苗供應,也無法保證疫情有效受控。全球疫苗產能有限,輝瑞明年可產劑量只夠6億多人使用,預料西方富國將透過預訂協議,購走絕大部分,其他國家及地區若要取得足夠疫苗,相信仍得依賴中國提供。
蘋果頭條
美國財政部今(10日)再宣佈新增制裁名單,增4名以「港版國安法」鎮壓香港異見者的港警高層及中國駐港官員,包括警務處副處長(國家安全)劉賜蕙及國家安全處高級警司李桂華。查冊顯示,劉、李兩人現分別持有西半山嘉富臺及藍田麗港城物業,而且仍有按揭貸款未還清。美國的制裁名單詳列兩人中英文全名、身份證及護照號碼,其中李桂華持有的麗港城住宅地址亦被公開。查冊顯示,李早於2013年12月以480萬元購入涉事單位,實用面積517平方呎,並獲中銀香港批出336萬元按揭貸款,餘下144萬元「首期」則為政府借出的貸款。查冊又顯示,李在今年4月已還清政府借出的144萬元貸款,不過中銀的按揭則仍未見還清;而按現時同屋苑的平均呎價估算,單位樓價已升值至約736萬元。
東方正論
衣食住行,樣樣都加,租金貴,樓價高,生活在香港本來已十分困難,現在遭逢疫境,經濟蕭條,市民面臨失業減薪,商戶生意劇減,營運成本卻不減,無論怎樣節流,電費都是必要支出。兩家電力公司醞釀加價,引起各界關注,政府年初起向住宅用戶發放共2,000元電費補貼,到下月便會完結。最新消息兩電未承諾明年減價,只是凍結電費,一毫不減,市民未有實質減輕負擔。港燈及中電昨日派代表前往立法會,在經濟事務委員會上交代明年電費調整,兩電聲稱增加機組為天然氣發電,面對巨大的電費調整壓力。但由於國際油價下跌,燃料調整費亦降低,抵銷基本電費的增幅,故來年港燈的淨電費維持每度電126.4仙,中電每度電仍舊121.8仙。
星島社論
全國人大常委會一連兩日開會,據悉,在今日閉幕會議將通過制訂涉及取消本港立法會議員資格的框架安排決定,包括確立議員被撤銷資格的標準,以及授權特區政府,可直接按框架標準撤銷不達標議員的資格,毋須經過法庭程序。據了解,今日一旦人大常委會公布決定後,政府擬隨即執行決定,宣布被DQ議員名單,料包括公民黨楊岳橋、郭榮鏗、郭家麒及專業議政梁繼昌四人。行政會議成員兼資深大律師湯家驊表示,過去幾年有很多人不斷去測試中央底線,中央「有需要不斷一條條底線劃清楚」,正是「求仁得仁」。人大常委會昨起一連兩日召開會議,據新華社報道,昨午會議在北京人民大會堂舉行,由委員長栗戰書主持,未提及有討論香港的議題。
經濟社評
疫情肆虐歐美之際,美國輝瑞藥廠研發的疫苗,傳出成效高的好消息,為控疫帶來曙光,也對其他藥廠起鼓舞作用。然而要讓全世界人都接種疫苗,先要解決疫苗有效性、安全性、保護力持久性、價錢便宜4大關鍵問題,而中國箇中扮演重要角色,西方與中國須衷誠合作,切勿各自為政。輝瑞與德國生物科技公司BioNTech宣布,其合作研發的疫苗保護效用率高逾90%。輝瑞準備向美國食品及藥物管理局(FDA)申請緊急使用授權,年底開始投產。目前有10款疫苗進入第三階段臨床測試,輝瑞先拔頭籌取得進展,可謂是個里程碑。由於輝瑞是舉世知名大藥廠,測試結果自然令人覺得可信,在當前歐洲多國為控疫要再度封城,美國每天單日新增逾10萬宗確診,無疑是在黑暗裏帶來一綫曙光。
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【五穀】任何五穀雜糧,只要用一個按鍵,輕鬆完成各式每日的精力湯品
【濃湯】平常煮南瓜濃湯,需要煮熟再用攪拌機打碎,而這台只需把生食連皮帶籽丟入調理機,10幾分鐘就能喝到一杯熱騰騰的營養湯品
【煲粥】它可以做出各式口味的粥品,並且帶有完整外型跟保留口感,並不是像濃湯一樣糊糊的哦^^
【藥膳】分3個時段,從20分~60分鐘的選擇,依食材投入時間,可調整藥材帶渣或溶解入湯水
【果汁】製作冷飲或冰沙不可或缺的功能,10~20秒快速完成,不要過度攪打才可保留食物美味、避免氧化更營養好喝
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👌組合裡的 #萬用鍋 也是煎、煮、蒸、烤、燉、滷、燜,各種料理都適用的萬用好幫手
【蔥燒玉子】使用【料理功能】可多段調整火力,快速升溫,簡單完成
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✔️冷飲,熱湯、冰品、蒸烤糕點、家常料理、宴客大菜、嬰幼兒副食品,或牙口不好的年長者、術後療養的營養補給,滿足多種飲食需求
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